第二期，是从三国初年（公元220年）到唐玄宗末年（公元755年）约五百五十年间，这名为中古期。在这中古期的开始，儒教还维系着前期的余势，经学的研究也相当兴盛；但是，支配当时的思潮，实是老、庄的哲学，在当时的经注中用老、庄思想来注释儒教经典的也很多。同时，据说后汉的时候已到了中国的印度思想（即佛教），到进了这中古期，突然增长了势力，成了真正为中国人所理解、所信奉的思想；另一方面，它刺激了风靡当时的中国固有的思想（即老、庄的思想），确立了称为道教的一种宗教。于是，到了这中古期的后半期，儒、道、佛三教鼎立地兴盛着。即是说，在隋、唐的时候，是儒、道、佛三教鼎立的时代；三教之中，有着深远的哲学的，是佛教，当时第一流的思想家、学者中，有许多都是佛教者。
第三期，是从唐玄宗（公元756年）以后到现在约一千二百年间，这名为近代期。近代期，时间很长，所以，又可以分为四个时代。第一，是从中唐到五代的二百余年间，这是宋学的准备时代。第二，是从北宋初（公元963年）到南宋末（公元1279年）的三百二十年间(2)，这是所谓的宋学时代。第三，是元、明两代，就是从公元1280—1661年的约三百八十年间(3)，这个时期的中心在于明代，元代是它的过渡期。第四，是清代，是所谓考证学全盛的时代，但是，在思想方面，并不发达。近代期，有鉴于第二期兴盛过的佛教哲学的深远，便以改造中国固有的儒教，构成新的体系，为主要的目的。