纯祐时期，蒙古部族兴起于北方草原，蒙古部贵族铁木真的迅速崛起，构成对夏国北方的严重威胁。天庆十二年（1205年），铁木真在消灭了乃蛮部以后，开始谋划进攻西夏。三月，铁木真借口夏国收纳了仇人桑昆，率兵攻入河西，相继攻破夏国力吉里寨、落思城与乞邻古撒城，并纵兵至瓜、沙诸州进行掳掠。对于蒙古铁骑的突然进攻，李纯祐束手无策，只得任其蹂躏。四月，因盛暑将至，铁木真率部掳掠了大批百姓和牲畜北返。蒙古军撤退后，李纯祐下令修复破损的城堡，加固城防，并大赦境内，改都城兴庆府为中兴府，他希望西夏在经过这场劫难之后，还能够再度中兴，恢复先祖昔日的辉煌。
然而，由于他专注于外事，忽略了内部政权的巩固，以至于给人以可乘之机。他的皇位正面临着严重的威胁。这个威胁来自于他的堂兄李安全与生母罗氏。李安全是越王李仁友之子。李仁友在仁宗时期因帮助仁宗谋诛外戚任得敬及其党羽，立下大功，因而被封为越王。天庆三年（1196年）十二月，越王去世，李安全上表请求纯祐表彰其父的军功，企图以此承袭其父的王爵。但是，李纯祐看出他怀有野心，因此拒绝，并且将他降封为镇夷郡王。李安全心生怨恨，开始有了篡权夺位的想法。他在皇太后罗氏的纵容下，逐渐把持了朝政，朝中大臣敢怒不敢言。
