后来九川在家闲居，又拿“格物”的学说去请教先生。先生回答说：“只要能实实在在地用功，时间久了自然会明白。”九川于是自己阅读《大学》的旧本，觉得朱熹的“格物”学说不正确。但他也怀疑先生把意念所在处看作“物”，“物”这个字还是没能理解。
己卯年，九川从京城回来，在洪都再次见到先生。先生虽然忙于军务，但还是抽空给他讲授。首先问他：“这几年用功用得怎么样？”九川说：“这几年我体会到，‘明明德’的功夫只是‘诚意’。从‘明明德于天下’开始，一步步推究到根源，到‘诚意’上就再也不能推了，为什么‘诚意’之前又有‘格物’‘致知’的功夫呢？后来又仔细体察，觉得意的真诚与否，必须先有知觉才行，以颜回说的‘有不善未尝知之，知之未尝复行’为证，我一下子豁然开朗，没有疑问了。却又多了一个‘格物’的功夫。我又思考，我心的灵明哪里会不知道意的善恶？只是被物欲遮蔽了，必须格去物欲，才能像颜回那样善恶尽知。我又怀疑自己的功夫颠倒了，与‘诚意’的功夫不能连成一片。后来我问希颜。希颜说：‘先生说“格物”“致知”是“诚意”的功夫，说得很好。’我问：‘为什么说是“诚意”的功夫？’希颜让我再仔细体察看看。我终究不能领悟，现在向您请教。”
